Ver el código de «/ESMValToolInst»

= Instalación de ESMValTool en papa-deimos =
A continuación se detallan los pasos seguidos para la instalación en papa-deimos de la herramienta [https://esmvaltool.org/ ESMValTool].

Se siguen los pasos encontrados en esta página [https://github.com/ESMValGroup/ESMValTool-JupyterLab ESMValTool-JupyterLab].

<PRE style="shell">
# cd /opt/conda/mamba/
# git clone https://github.com/ESMValGroup/ESMValTool
# cd ESMValTool/
# /opt/conda/mamba/DE-global_hackathon/miniconda3/bin/mamba env create -f environment.yml --name esmvaltool
</PRE>

Activando el entorno y terminando la instalación
<PRE style="shell">
# eval "$(/opt/conda/mamba/DE-global_hackathon/miniconda3/bin/mamba shell hook --shell bash)"
# mamba activate esmvaltool
(esmvaltool) # pip install --editable '.[develop]'
(esmvaltool) # pre-commit install
</PRE>

La instalación de Julia falla
<PRE style="shell">
(esmvaltool) # esmvaltool install Julia
</PRE>

Activación kernel para jupyterHUB
<PRE style="shell">
# pip3 install ipykernel
# mamba deactivate
# /opt/conda/mamba/DE-global_hackathon/miniconda3/envs/esmvaltool/bin/python3 -m ipykernel install
# /opt/tljh/user/bin/jupyter-kernelspec install /usr/local/share/jupyter/kernels/python3 --name=python_esmvaltools
# /opt/tljh/user/bin/jupyter-kernelspec list
Available kernels:
  python3                 /opt/tljh/user/share/jupyter/kernels/python3
  bash                    /usr/local/share/jupyter/kernels/bash
  ir                      /usr/local/share/jupyter/kernels/ir
  python_atrackcs         /usr/local/share/jupyter/kernels/python_atrackcs
  python_digearth-hack    /usr/local/share/jupyter/kernels/python_digearth-hack
  python_esmvaltools      /usr/local/share/jupyter/kernels/python_esmvaltools
</PRE>

Editando acceso a kernel para acerlo más identificable
<PRE style="shell">
# vim /usr/local/share/jupyter/kernels/python_esmvaltools/kernel.json
 "display_name": "Python 3 (esmvaltools)",
 "env": {
  "MAMBA_PREFIX":"/opt/conda/mamba/DE-global_hackathon/miniconda3/envs/esmvaltool",
  "MAMBA_DEFAULT_ENV":"esmvaltool",
  "PATH":"/opt/conda/mamba/DE-global_hackathon/miniconda3/envs/esmvaltool/bin:/opt/conda/mamba/DE-global_hackathon/
miniconda3/condabin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin"
 },
</PRE>

Preparando configuración
<PRE style="shell">
(esmvaltool) # esmvaltool config get_config_user
</PRE>

La ejecución en Deimos falla, ya creé un issue en el GIThub de ESMValTool [https://github.com/ESMValGroup/ESMValCore/issues/2739 #2739]