CMAQ - Historial de revisiones

Solange.luque: /* Hermes */

2023-10-18T16:30:32Z

Hermes

Solange.luque: /* Ejecución */

2023-10-18T16:25:34Z

Ejecución

← Revisión anterior		Revisión del 16:25 18 oct 2023
Línea 1404:		Línea 1404:
	mpirun -np 8 hermesv3_gr --my-config '/home/sol/HERMES/HERMES_IN/conf/hermes.conf'		mpirun -np 8 hermesv3_gr --my-config '/home/sol/HERMES/HERMES_IN/conf/hermes.conf'
	</pre>		</pre>

			Esto tarda en correr, pero debiera ir creando los ficheros de las emisiones en el path de salida que elegimos. No hay que hacerles nada, funcionan así directamente con CMAQ.

Solange.luque: /* Fichero de niveles verticales */

2023-09-25T16:47:27Z

Fichero de niveles verticales

← Revisión anterior		Revisión del 16:47 25 sep 2023
Línea 1216:		Línea 1216:
	==== Fichero de niveles verticales ====		==== Fichero de niveles verticales ====

	Tenemos que darle un fichero que diga hasta que altura va cada nivel vertical. Para eso vamos a usar el script <code>vertical_layers_conf.py</code> que está en GIT [[https://git.cima.fcen.uba.ar/solange.luque/hermes/-/tree/main/Edgar]]. Para correr este script necesitamos algún fichero de salida de WRF o el output <code>METCRO3D.nc</code> que es salida de MCIP. OJO, NO DAN EXACTAMENTE IGUAL. ~~OJO, EN LA SALIDA DE REAL EN LOS RSL.OUT ESTÁ LA ALTURA DE CADA NIVEL, CAPAZ CONVIENE USAR ESO DIRECTAMENTE~~.		Tenemos que darle un fichero que diga hasta que altura va cada nivel vertical. Para eso vamos a usar el script <code>vertical_layers_conf.py</code> que está en GIT [[https://git.cima.fcen.uba.ar/solange.luque/hermes/-/tree/main/Edgar]]. Para correr este script necesitamos algún fichero de salida de WRF o el output <code>METCRO3D.nc</code> que es salida de MCIP. OJO, NO DAN EXACTAMENTE IGUAL. Con el de CMAQ corre sin quejarse. No probé el de WRF así que recomiendo usar la versión de CMAQ

	<pre style = "shell">		<pre style = "shell">

Solange.luque: /* Fichero configuración de WRF */

2023-09-22T16:42:31Z

Fichero configuración de WRF

← Revisión anterior		Revisión del 16:42 22 sep 2023
Línea 1204:		Línea 1204:
	DT,12		DT,12
	MMINLU,MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH		MMINLU,MODIFIED_IGBP_MODIS_NOAH
	NUM_LAND_CAT,20		NUM_LAND_CAT,21
	ISWATER,17		ISWATER,17
	ISLAKE,-1		ISLAKE,21
	ISICE,15		ISICE,15
	ISURBAN,13		ISURBAN,13
Línea 1213:		Línea 1213:
	CEN_LON,-58.56366		CEN_LON,-58.56366
	</pre>		</pre>


	==== Fichero de niveles verticales ====		==== Fichero de niveles verticales ====

Solange.luque: /* Instalación y corrección de errores de Hermes */

2023-09-07T17:29:32Z

Instalación y corrección de errores de Hermes

← Revisión anterior		Revisión del 17:29 7 sep 2023
Línea 900:		Línea 900:
	</pre>		</pre>

	También hay que cambiar un par de cosas numpy. A partir de la versión 1.20 no se usa más "np.float" sino directamente "float", salvo que se use np.float32 o np.float64 (idem con int) (Ver la tabla de acá [[https://numpy.org/devdocs/release/1.20.0-notes.html#deprecations]]). Se podría instalar una versión anterior, pero parece que es vieja y no se puede instalar bien. Lo más directo parece ser cambiar este tipo de cosas en ~~los siguientes scripts~~:		También hay que cambiar un par de cosas numpy. A partir de la versión 1.20 no se usa más "np.float" sino directamente "float", salvo que se use np.float32 o np.float64 (idem con int) (Ver la tabla de acá [[https://numpy.org/devdocs/release/1.20.0-notes.html#deprecations]]). Se podría instalar una versión anterior, pero parece que es vieja y no se puede instalar bien. Lo más directo parece ser cambiar este tipo de cosas en el siguiente script, que es el único con problemas:

	<pre style="shell">		<pre style="shell">
	/home/sol/hermes/lib/python3.8/site-packages/hermesv3_gr-2.1.3-py3.8.egg/hermesv3_gr/modules/writing/writer_cmaq.py		/home/sol/hermes/lib/python3.8/site-packages/hermesv3_gr-2.1.3-py3.8.egg/hermesv3_gr/modules/writing/writer_cmaq.py

	</pre>		</pre>

Solange.luque: /* Instalación y corrección de errores de Hermes */

2023-09-07T17:24:27Z

Instalación y corrección de errores de Hermes

← Revisión anterior		Revisión del 17:24 7 sep 2023
Línea 903:		Línea 903:

	<pre style="shell">		<pre style="shell">
	/home/sol/hermesv3_gr/hermesv3_gr/modules/writing/writer_cmaq.py		/home/sol/hermes/lib/python3.8/site-packages/hermesv3_gr-2.1.3-py3.8.egg/hermesv3_gr/modules/writing/writer_cmaq.py

	</pre>		</pre>

Solange.luque: /* Instalación y corrección de errores de Hermes */

2023-09-07T17:16:50Z

Instalación y corrección de errores de Hermes

← Revisión anterior		Revisión del 17:16 7 sep 2023
Línea 898:		Línea 898:
	<pre style="shell">		<pre style="shell">
	esmfmk = "/home/sol/hermesv3_gr/Libraries/esmf/esmf-8.5.0/lib/libO/Linux.gfortran.64.mpich.default/esmf.mk"		esmfmk = "/home/sol/hermesv3_gr/Libraries/esmf/esmf-8.5.0/lib/libO/Linux.gfortran.64.mpich.default/esmf.mk"
			</pre>

			También hay que cambiar un par de cosas numpy. A partir de la versión 1.20 no se usa más "np.float" sino directamente "float", salvo que se use np.float32 o np.float64 (idem con int) (Ver la tabla de acá [[https://numpy.org/devdocs/release/1.20.0-notes.html#deprecations]]). Se podría instalar una versión anterior, pero parece que es vieja y no se puede instalar bien. Lo más directo parece ser cambiar este tipo de cosas en los siguientes scripts:

			<pre style="shell">
			/home/sol/hermesv3_gr/hermesv3_gr/modules/writing/writer_cmaq.py

	</pre>		</pre>

Solange.luque: /* Ejecución */

2023-09-07T16:37:57Z

Ejecución

← Revisión anterior		Revisión del 16:37 7 sep 2023
Línea 1329:		Línea 1329:
	p_day = <input_dir>/data/profiles/temporal/TemporalProfile_Daily.csv		p_day = <input_dir>/data/profiles/temporal/TemporalProfile_Daily.csv
	p_hour = <input_dir>/data/profiles/temporal/TemporalProfile_Hourly.csv		p_hour = <input_dir>/data/profiles/temporal/TemporalProfile_Hourly.csv
	p_speciation = <input_dir>/data/profiles/speciation/~~Speciation_profile_cb06_aero7_Benchmark~~.csv		p_speciation = <input_dir>/data/profiles/speciation/Speciation_profile_cb06_aero7_CMAQ.csv

	molecular_weights = <input_dir>/data/profiles/speciation/MolecularWeights.csv		molecular_weights = <input_dir>/data/profiles/speciation/MolecularWeights.csv

Solange.luque: /* Instalación */

2023-09-07T16:05:36Z

Instalación

← Revisión anterior		Revisión del 16:05 7 sep 2023
Línea 801:		Línea 801:
	</pre>		</pre>

	~~NOTA~~: Cuidado con instalar un pandas con versión igual a mayor a 2.0 porque el "append" para un dataframe no se usa más a partir de esa versión y sí se usa en los scripts. Si se instalara una versión superior habría que cambiar los scripts. La recomendación sería instalar una versión inferior y listo.		NOTA1: Cuidado con instalar un pandas con versión igual a mayor a 2.0 porque el "append" para un dataframe no se usa más a partir de esa versión y sí se usa en los scripts. Si se instalara una versión superior habría que cambiar los scripts. La recomendación sería instalar una versión inferior y listo.

			NOTA2: Si se instala un esmpy posterior a 8.4.0 (Abajo se describe como) hay que renombrar algunas funciones y como se importa el paquete. Abajo se describe. Se puede instalar 7.1.0r que es lo mínimo que pide Hermes y no hay que cambiar nada de los scripts, PERO es una versión vieja que se instala de otra forma y tiene otras complicaciones.

			NOTA3: Aparentemente no cualquier versión de netCDF4 funciona bien. En particular la 1.6.4 tira segmentation faults (No al importarlo solo uno a mano, pero sí al funcionar con el resto de las librerías). Netcdf4 1.5.6 con ESMF 8.5.0 funciona bien. Otras combinaciones a chequear.

	~~Si se instala un esmpy posterior a 8.4.0 hay que renombrar algunas funciones y como se importa el paquete. Abajo se describe. Si se puede, conviene instalar 7.1.0r que es lo mínimo que pide Hermes.~~

	=== Otros programas ===		=== Otros programas ===

Solange.luque: /* ESMF */

2023-09-06T18:09:11Z

ESMF

← Revisión anterior		Revisión del 18:09 6 sep 2023
Línea 819:		Línea 819:
	<pre style = "shell">		<pre style = "shell">
	cd /home/sol/hermesv3_gr/Libraries/esmf/		cd /home/sol/hermesv3_gr/Libraries/esmf/
	cd esmf-~~ESMF_7_1_0rbranch~~		cd esmf-8.5.0
	</pre>		</pre>

Línea 825:		Línea 825:

	<pre style = "shell">		<pre style = "shell">
	export ESMF_DIR=/home/sol/hermesv3_gr/Libraries/esmf/esmf-8.4.1		export ESMF_DIR=/home/sol/hermesv3_gr/Libraries/esmf/esmf-8.5.0
	export ESMF_NETCDF=nc-config		export ESMF_NETCDF=nc-config
	export ESMF_COMM=mpich		export ESMF_COMM=mpich