ORCHIDEE - Historial de revisiones

Lluis.fita: /* salida */

2026-09-25T19:47:29Z

salida

← Revisión anterior		Revisión del 19:47 25 sep 2026
Línea 270:		Línea 270:
	</PRE>		</PRE>

			==== copia a Papa-Deimos ====
	Si querés que Lluís te suba las salidas a Papa-Deimos, antes tendrás que darle acceso al direcorio de la salida de la simulación mediante		Si querés que Lluís te suba las salidas a Papa-Deimos, antes tendrás que darle acceso al direcorio de la salida de la simulación mediante
	<PRE style="shell">		<PRE style="shell">
	chmod a+r [storageHOME]		chmod a+r -R [storageHOME]
	</PRE>		</PRE>

Lluis.fita: /* Ejemplo básico */

2026-09-25T19:47:01Z

Ejemplo básico

← Revisión anterior		Revisión del 19:47 25 sep 2026
Línea 268:		Línea 268:
	<PRE>		<PRE>
	/datos/MOD/ORCHIDEE/benchmark/OR4L_fast_daily/orig		/datos/MOD/ORCHIDEE/benchmark/OR4L_fast_daily/orig
			</PRE>

			Si querés que Lluís te suba las salidas a Papa-Deimos, antes tendrás que darle acceso al direcorio de la salida de la simulación mediante
			<PRE style="shell">
			chmod a+r [storageHOME]
	</PRE>		</PRE>

Lluis.fita en 15:08 25 sep 2026

2026-09-25T15:08:17Z

← Revisión anterior		Revisión del 15:08 25 sep 2026
Línea 439:		Línea 439:
	qsub launch_orchidee.pbs		qsub launch_orchidee.pbs
	</pre>		</pre>
	~~-->~~

	~~<!--~~
	== Test: let's look at Marcos Juárez, Córdoba, Argentina ==		== Test: let's look at Marcos Juárez, Córdoba, Argentina ==

Línea 699:		Línea 697:
	python3 $pyHOME3/nc_var.py -o valmod -S mulc,3600 -f ~/sandbox/get/WFDE5_CRU_GPCC_2002.nc -v time		python3 $pyHOME3/nc_var.py -o valmod -S mulc,3600 -f ~/sandbox/get/WFDE5_CRU_GPCC_2002.nc -v time
	python3 $pyHOME3/nc_var.py -o varaddattrk -S 'units\|seconds!since!1900-01-01!00:00:00\|S' -v time -f sandbox/get/WFDE5_CRU_GPCC_2002.nc		python3 $pyHOME3/nc_var.py -o varaddattrk -S 'units\|seconds!since!1900-01-01!00:00:00\|S' -v time -f sandbox/get/WFDE5_CRU_GPCC_2002.nc
	~~-->~~

	If everything went fine, one should have (at least)		If everything went fine, one should have (at least)

Lluis.fita: /* Test: let's look at Marcos Juárez, Córdoba, Argentina */

2026-09-25T15:06:50Z

Test: let's look at Marcos Juárez, Córdoba, Argentina

← Revisión anterior		Revisión del 15:06 25 sep 2026
Línea 441:		Línea 441:
	-->		-->

			<!--
	== Test: let's look at Marcos Juárez, Córdoba, Argentina ==		== Test: let's look at Marcos Juárez, Córdoba, Argentina ==

Línea 734:		Línea 735:
	/share/ORCHIDEE/modipsl/modeles/IOIPSL/bin/rebuild -o sechiba_history.nc sechiba_history_????.nc		/share/ORCHIDEE/modipsl/modeles/IOIPSL/bin/rebuild -o sechiba_history.nc sechiba_history_????.nc
	</pre>		</pre>
			-->

	== Running the model in DCAO's computational lab ==		== Running the model in DCAO's computational lab ==

Lluis.fita: /* Benchmark */

2026-09-25T15:06:32Z

Benchmark

← Revisión anterior		Revisión del 15:06 25 sep 2026
Línea 270:		Línea 270:
	</PRE>		</PRE>

			<!--
	== Benchmark ==		== Benchmark ==

Línea 438:		Línea 439:
	qsub launch_orchidee.pbs		qsub launch_orchidee.pbs
	</pre>		</pre>
			-->

	== Test: let's look at Marcos Juárez, Córdoba, Argentina ==		== Test: let's look at Marcos Juárez, Córdoba, Argentina ==

Lluis.fita: /* Ejemplo básico */

2026-09-25T15:06:03Z

Ejemplo básico

← Revisión anterior		Revisión del 15:06 25 sep 2026
Línea 161:		Línea 161:
	La idea del workflow es la siguiente:		La idea del workflow es la siguiente:
	* <CODE>domainHOME</CODE>: directorio con toda la información de las namelists. Es donde tiene que moverse el directorio EXPinf		* <CODE>domainHOME</CODE>: directorio con toda la información de las namelists. Es donde tiene que moverse el directorio EXPinf
	* <CODE>expHOME</CODE>: directorio raíz del workflow. En donde se lanza por primera vez el job inicial del workflow llamado <CODE>'launch_experiment.pbs'<CODE>. De este directorio se creará la estructura de directorios de la parte de manejo del workflow. Este directorio se llamará <CODE>[ExpName]/[SimName]</CODE> (los valores de <CODE>[ExpName]</CODE> y <CODE>[SimName]</CODE> están definidos dentro de <CODE>EXPERIMENTSparameters.txt</CODE>)		* <CODE>expHOME</CODE>: directorio raíz del workflow. En donde se lanza por primera vez el job inicial del workflow llamado <CODE>'launch_experiment.pbs'</CODE>. De este directorio se creará la estructura de directorios de la parte de manejo del workflow. Este directorio se llamará <CODE>[ExpName]/[SimName]</CODE> (los valores de <CODE>[ExpName]</CODE> y <CODE>[SimName]</CODE> están definidos dentro de <CODE>EXPERIMENTSparameters.txt</CODE>)
	* <CODE>runHOME</CODE>: directorio donde correrá el modelo (distinto de <CODE>'expHOME'</CODE>). En este directorio se creará también los nuevos directorios <CODE>[ExpName]/[SimName]</CODE>		* <CODE>runHOME</CODE>: directorio donde correrá el modelo (distinto de <CODE>'expHOME'</CODE>). En este directorio se creará también los nuevos directorios <CODE>[ExpName]/[SimName]</CODE>
	* <CODE>storageHOME</CODE>: directorio donde se guardarán las salidas y los logs de la simulación. En este directorio también se creará la estructura <CODE>[ExpName]/[SimName]</CODE>		* <CODE>storageHOME</CODE>: directorio donde se guardarán las salidas y los logs de la simulación. En este directorio también se creará la estructura <CODE>[ExpName]/[SimName]</CODE>

Lluis.fita: /* ¿Cómo simular? */

2026-09-25T15:05:36Z

¿Cómo simular?

← Revisión anterior		Revisión del 15:05 25 sep 2026
Línea 178:		Línea 178:
	/home/[user]/salidas/estudios		/home/[user]/salidas/estudios
	</PRE>		</PRE>

	# Crear el directorio raíz del workflow (el <CODE>expHOME</CODE>). Por ejemplo		# Crear el directorio raíz del workflow (el <CODE>expHOME</CODE>). Por ejemplo
	<PRE>		<PRE>
	/home/[user]/salidas/estudios/ORtest		/home/[user]/salidas/estudios/ORtest
	</PRE>		</PRE>

	# Desde <CODE>/home/[user]/salidas/estudios/ORtest</CODE>, copia:		# Desde <CODE>/home/[user]/salidas/estudios/ORtest</CODE>, copia:
	<PRE>		<PRE>
Línea 188:		Línea 190:
	ENTparameters.txt ./		ENTparameters.txt ./
	</PRE>		</PRE>

	# Adapta los valores de <CODE>EXPERIMENTSparamaters.txt</CODE> a tu antojo. Por ejemplo:		# Adapta los valores de <CODE>EXPERIMENTSparamaters.txt</CODE> a tu antojo. Por ejemplo:
	<PRE>		<PRE>
	domainHOME = /home/[user]/salidas/EXPS/ORtest/EXPinf		domainHOME = /home/[user]/salidas/EXPS/ORtest/EXPinf
	expHOME = /home/[user]/salidas/estudios/ORtest		expHOME = /home/[user]/salidas/estudios/ORtest
	runHOME = /home/[user]/salidas/RUN/ORtest		runHOME = /home/[user]/salidas/RUN/ORtest
	storageHOME = /home/[user]/salidas/EXPS/ORtest		storageHOME = /home/[user]/salidas/EXPS/ORtest
	</PRE>		</PRE>

	# Modifica el valor de <CODE>[user]</CODE> de <CODE>launch_experiment.pbs</CODE>		# Modifica el valor de <CODE>[user]</CODE> de <CODE>launch_experiment.pbs</CODE>
	<PRE>		<PRE>
	#PBS -M [user]@cima.fcen.uba.ar		#PBS -M [user]@cima.fcen.uba.ar
	</PRE>		</PRE>

	# Ya podés lanzar la simulación test		# Ya podés lanzar la simulación test
	<PRE>		<PRE>
	qsub launch_experiment.pbs		qsub launch_experiment.pbs
	</PRE>		</PRE>

Línea 208:		Línea 213:
	Yo propongo lo siguiente:		Yo propongo lo siguiente:
	# Probá el test		# Probá el test
	# Creá una nueva simulación (cambiándole el nombre y modificando algún valor del run.def). Esto se puede hacer desde <CODE>EXPERIMENTparameters.txt</CODE> en la entrada: <CODE>nlparameter</CODE>s. Por ejemplo duplícale el valor del CO2 atmosférico a 700.		# Creá una nueva simulación (cambiándole el nombre y modificando algún valor del <CODE>run.def</CODE>). Esto se puede hacer desde <CODE>EXPERIMENTparameters.txt</CODE> en la entrada: <CODE>nlparameter</CODE>s. Por ejemplo duplícale el valor del CO2 atmosférico a 700.
	# Corré una nueva simulación que corra 3 meses con trozos de 1 mes		# Corré una nueva simulación que corra 3 meses con trozos de 1 mes

Lluis.fita: /* ¿Cómo simular? */

2026-09-25T15:04:43Z

¿Cómo simular?

← Revisión anterior		Revisión del 15:04 25 sep 2026
Línea 185:		Línea 185:
	<PRE>		<PRE>
	cp /share/tools/workflows/OR4L/hydra/launch_experiment.pbs ./		cp /share/tools/workflows/OR4L/hydra/launch_experiment.pbs ./
	cp /share/tools/workflows/OR4L/hydra/examples/OR4L_fast_daily/~~EXPERIMENTparameters~~.txt ./		cp /share/tools/workflows/OR4L/hydra/examples/OR4L_fast_daily/EXPERIM
			ENTparameters.txt ./
	</PRE>		</PRE>
	# Adapta los valores de <CODE>EXPERIMENTSparamaters.txt</CODE> a tu antojo. Por ejemplo:		# Adapta los valores de <CODE>EXPERIMENTSparamaters.txt</CODE> a tu antojo. Por ejemplo:

Lluis.fita: /* ¿Cómo simular? */

2026-09-25T15:04:26Z

¿Cómo simular?

← Revisión anterior		Revisión del 15:04 25 sep 2026
Línea 184:		Línea 184:
	# Desde <CODE>/home/[user]/salidas/estudios/ORtest</CODE>, copia:		# Desde <CODE>/home/[user]/salidas/estudios/ORtest</CODE>, copia:
	<PRE>		<PRE>
	cp /share/tools/workflows/OR4L/hydra/launch_experiment.pbs ./		cp /share/tools/workflows/OR4L/hydra/launch_experiment.pbs ./
	cp /share/tools/workflows/OR4L/hydra/examples/OR4L_fast_daily/EXPERIMENTparameters.txt		cp /share/tools/workflows/OR4L/hydra/examples/OR4L_fast_daily/EXPERIMENTparameters.txt ./
	</PRE>		</PRE>
	# Adapta los valores de <CODE>EXPERIMENTSparamaters.txt</CODE> a tu antojo. Por ejemplo:		# Adapta los valores de <CODE>EXPERIMENTSparamaters.txt</CODE> a tu antojo. Por ejemplo:

Lluis.fita: /* ¿Cómo simular? */

2026-09-25T15:04:02Z

¿Cómo simular?

← Revisión anterior		Revisión del 15:04 25 sep 2026
Línea 185:		Línea 185:
	<PRE>		<PRE>
	cp /share/tools/workflows/OR4L/hydra/launch_experiment.pbs ./		cp /share/tools/workflows/OR4L/hydra/launch_experiment.pbs ./
	cp		cp /share/tools/workflows/OR4L/hydra/examples/OR4L_fast_daily/EXPERIMENTparameters.txt
	/share/tools/workflows/OR4L/hydra/examples/OR4L_fast_daily/EXPERIMENTparameters.txt
	</PRE>		</PRE>
	# Adapta los valores de <CODE>EXPERIMENTSparamaters.txt</CODE> a tu antojo. Por ejemplo:		# Adapta los valores de <CODE>EXPERIMENTSparamaters.txt</CODE> a tu antojo. Por ejemplo: