Revisión actual - 19:13 21 may 2025

Uso de papa-deimos

Toda persona del CIMA/DCAO tiene acceso al equipamiento.

Se tiene que mandar un correo a Lluís para que active la cuenta.

Una vez la cuenta activada, el acceso se hace por registro de usuarie desde

http://deimos.cima.fcen.uba.ar/

Por el momento, están activados los notebooks de 'python', 'R' y 'shell'. Cada tipo de `notebook' se selecciona en el menú desplegable llamado `new' (arriba a la derecha, ver imagen).

NOTA: No se permite la creación de entornos python. Si se necesitan paquetes específicos, pídanlos a Lluís Fita

Todos los archivos que se creen aparecen en la ventana inicial para poderse descargar

Usuaries

Les usuaries se conectan y se abren una sesión activa en un `notebook' y se empieza a trabajar con los datos

CIMA: Usuaries CIMA con la cuenta creada, usan el mismo nombre del correo (sin @cima.fcen.uba.ar) y con la misma contraseña que la del correo

Cada [usarie] tendrá un home del gitHUB ubicado en

/home/jupyter-[usuarie]

Sesión activa sin conexión

Existe una manera de dejar corriendo un kernel de python y cerrar la sesión en Papa-Deimos. Para eso se utiliza el decorator %%capture

A continuación se describe un ejemplo muy sencillo.

Este sería el código en una celda:

%%capture mi_salida

import time

Ntimes = 10
Nseconds = 10

for it in range(Ntimes):
    print (it)
    time.sleep(Nseconds)

Se ejecuta la celda y se sale de la sesión de Papa-Deimos.

Cuando volvemos a conectarnos, sólo hace falta ir al kernel y en la celda posterior escribir:

mi_salida.show()

y al ejecutar la celda del kernel:

kernels/entornos

No se autoriza la creación de entornos por usuario. Si existiera algún problema, se ruega pedir auyda a Lluís Fita.

A continuación se describen los paquetes adicionales que contienen los kernels activos

Bash: entorno estándard de shell
Python3 (D. E. Hachkathon): xarray, dask, intake, HEALpix, easy.gems HEALPix, healpy, py-zarr, Tobac, PyFLEXTRKR
Python3 (atrackcs): ATRACKCS
Python3 (ipykernel): estándard python3
R: básico R

@@ Línea 1: / Línea 1: @@
 = Uso de papa-deimos =
+__TOC__
 Toda persona del CIMA/DCAO tiene acceso al equipamiento.
@@ Línea 9: / Línea 11: @@
 [http://deimos.cima.fcen.uba.ar/ http://deimos.cima.fcen.uba.ar/]
-Por el momento, sólo está activado los notebooks de 'python'. Se espera poder activar los de 'R' pronto.
+Por el momento, están activados los notebooks de 'python', 'R' y 'shell'. Cada tipo de '' `notebook' '' se selecciona en el menú desplegable llamado ''`new''' (arriba a la derecha, ver imagen).
+'''NOTA:''' No se permite la creación de entornos python. Si se necesitan paquetes específicos, pídanlos a Lluís Fita
+[[File:jupyterHUB_home_small.png|center]]
+Todos los archivos que se creen aparecen en la ventana inicial para poderse descargar
 == Usuaries ==
-Les usuaries se conectan y se abren una sesión activa en un note book y se empieza a trabajar con los datos
+Les usuaries se conectan y se abren una sesión activa en un '' `notebook' '' y se empieza a trabajar con los datos
+* CIMA: Usuaries CIMA con la cuenta creada, usan el mismo nombre del correo (sin <code>@cima.fcen.uba.ar</code>) y con la misma contraseña que la del correo
+Cada [usarie] tendrá un home del gitHUB ubicado en
+<pre>
+/home/jupyter-[usuarie]
+</pre>
+== Sesión activa sin conexión ==
+Existe una manera de dejar corriendo un kernel de python y cerrar la sesión en Papa-Deimos. Para eso se utiliza el ''decorator'' <code>%%capture</code>
+A continuación se describe un ejemplo muy sencillo.
+Este sería el código en una celda:
+<pre style="python">
+%%capture mi_salida
+import time
+Ntimes = 10
+Nseconds = 10
+for it in range(Ntimes):
+    print (it)
+    time.sleep(Nseconds)
+</pre>
+Se ejecuta la celda y se sale de la sesión de Papa-Deimos.
+Cuando volvemos a conectarnos, sólo hace falta ir al kernel y en la celda posterior escribir:
+<pre>
+mi_salida.show()
+</pre>
+y al ejecutar la celda del kernel:
+<pre>
+</pre>
+== kernels/entornos ==
+No se autoriza la creación de entornos por usuario. Si existiera algún problema, se ruega pedir auyda a Lluís Fita.
-== Datos ==
+A continuación se describen los paquetes adicionales que contienen los kernels activos
+* Bash: entorno estándard de shell
+* Python3 (D. E. Hachkathon): xarray, dask, [https://intake.readthedocs.io/en/latest/index.html intake], [https://healpix.sourceforge.io/ HEALpix], [https://easy.gems.dkrz.de/Processing/healpix/index.html easy.gems HEALPix], healpy, [https://zarr.dev/ py-zarr], [https://tobac.readthedocs.io/en/latest/ Tobac], [https://github.com/FlexTRKR/PyFLEXTRKR PyFLEXTRKR]
+* Python3 (atrackcs): [https://github.com/ATRACKCS/ATRACKCS ATRACKCS]
+* Python3 (ipykernel): estándard python3
+* R: básico R