Guía de usuario del SCAD del CIMA

Elegir librerías a utilizar (Intel o GNU)

Por defecto no se cargan variables para los compiladores.

• GNU: Si desea utilizar compiladores GNU es necesario ejecutar el siguiente comando:

source /opt/gnu/load_gnu-10.2.1.sh

• INTEL: Si desea utilizar compiladores Intel es necesario ejecutar el siguiente comando:

source /opt/intel/load_intel-2021.4.0.sh

Para ejecutar un trabajo:

• En el pbs elijo la cantidad de nodos y procesadores que quiero utilizar. Ejemplo para 8 nodos de 1 procesador cada uno:

#PBS -l nodes=8:ppn=1 
PROC_NO=8

• Otro ejemplo es elegir 3 nodos de dos procesadores cada uno:

#PBS -l nodes=3:ppn=2
PROC_NO=6

• Por último, debemos indicar que cola se usará. Actualmente hay sólo una cola (larga)

#PBS -q larga

• Una vez que esta todo modificado ejecutamos:

qsub corrida.pbs

• Para visualizar lo que ejecutamos y el estado:

qstat –n

• Para matar el trabajo que enviamos:

qdel <número de trabajo> (número de trabajo lo sabemos haciendo qstat –n)

• Config de un archivo PBS típico

## Job Name
#PBS -N nombreJob

## Novedades por mail
#PBS -m abe
#PBS -M <my.user>@cima.fcen.uba.ar

## Joins standard and Error outputs in a single file
#PBS -j oe

## Queue
#PBS -q larga

## resources
#PBS -l nodes=3:ppn=1