Diferencia entre revisiones de «RegIPSL/CompHDF NC»
(→HDF5) |
(→HDF5) |
||
| Línea 28: | Línea 28: | ||
CC=mpicc FC=mpif90 CFLAGS=-fPIC | CC=mpicc FC=mpif90 CFLAGS=-fPIC | ||
./configure --enable-shared --enable-parallel --enable-fortran --enable-fortran2003 --prefix=$HDF5 >& ./run_configure.log | ./configure --enable-shared --enable-parallel --enable-fortran --enable-fortran2003 --prefix=$HDF5 >& ./run_configure.log | ||
</pre> | |||
Se verifica que la configuración de la instalación no haya dado problemas (mirar el archivo <code>run_configure.log</code>). Si no hay problemas, ya se pude compilar: | |||
<pre style="shell"> | |||
make && make install >& run_make.log | make && make install >& run_make.log | ||
</pre> | </pre> | ||
Revisión del 14:46 22 nov 2023
Compilación en paralelo de HDF5 y netCDF en hydra
Se siguen estas instrucciones de acá
Descargamos los códigos en el $INSWORKDIR (en este caso INSWORKDIR=/home/lluis.fita/installs/):
Compilaremos con intel, así que cargamos el entorno correspondiente:
$ source /opt/load-libs.sh 1
HDF5
Código del HDF5 obtenido de la página HDF5source (archivo $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/hdf5-1.14.3.tar.gz)
$ cd $INSWORKDIR
$ mkdir hdf5
$ mkdir -p 1.14.3/intel/parallel
$ cd 1.14.3/intel/parallel
$ mkdir ins
$ cd hdf5-1.14.3
$ tar xvfz ../../hdf5-1.14.3.tar.gz
Compilamos el código en el directorio $HDF5 (estando en $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/hdf5-1.14.3)
export HDF5=$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/ins
CC=mpicc FC=mpif90 CFLAGS=-fPIC
./configure --enable-shared --enable-parallel --enable-fortran --enable-fortran2003 --prefix=$HDF5 >& ./run_configure.log
Se verifica que la configuración de la instalación no haya dado problemas (mirar el archivo run_configure.log). Si no hay problemas, ya se pude compilar:
make && make install >& run_make.log
NETCDF
$ git clone https://github.com/Unidata/netcdf-c.git