Ver el código fuente de «RegIPSL/CompHDF NC»

= Compilación en paralelo de HDF5 y netCDF en hydra =
Se siguen estas instrucciones de [https://gist.github.com/milancurcic/3a6c1a97a99d291f88cc61dae6621bdf acá]

Descargamos los códigos en el <code>$INSWORKDIR</code> (en este caso <code>INSWORKDIR=/home/lluis.fita/installs/<code>):

Compilaremos con intel, así que cargamos el entorno correspondiente:
<pre style="shell">
$ source /opt/load-libs.sh 1
</pre>

== HDF5 ==

Código del HDF5 obtenido de la página [https://www.hdfgroup.org/downloads/hdf5/source-code/ HDF5source] (archivo <code>$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/hdf5-1.14.3.tar.gz</code>)

<pre style="shell">
$ cd $INSWORKDIR
$ mkdir hdf5
$ mkdir -p 1.14.3/intel/parallel
$ cd 1.14.3/intel/parallel
$ mkdir ins
$ cd hdf5-1.14.3
$ tar xvfz ../../hdf5-1.14.3.tar.gz
</pre>

Compilamos el código en el directorio <code>$HDF5</code> (estando en <code>$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/hdf5-1.14.3</code>)
<pre style="shell">
export HDF5=$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/ins
CC=mpicc FC=mpif90 CFLAGS=-fPIC 
./configure --enable-shared --enable-parallel --enable-fortran --enable-fortran2003 --prefix=$HDF5 >& ./run_configure.log
</pre>
Se verifica que la configuración de la instalación no haya dado problemas (mirar el archivo <code>run_configure.log</code>). Si no hay problemas, ya se pude compilar:
<pre style="shell">
make >& run_make.log
</pre>

Se verifica que la compilación no haya dado problemas (mirar el archivo <code>run_make.log</code>). Si no hay problemas, ya se pude instalar:
<pre style="shell">
make install >& run_make-ins.log
</pre>

Si no hubo problemas tendríamos que tener en <code>$HDF5/bin</code> (sólo cómo ejemplo):
<pre style="shell">
$ cd $HDF5/bin
$ ls
h5clear   h5format_convert  h5pcc          h5repart
h5copy    h5fuse.sh         h5perf         h5stat
h5debug   h5import          h5perf_serial  h5tools_test_utils
h5delete  h5jam             h5pfc          h5unjam
h5diff    h5ls              h5redeploy     h5watch
h5dump    h5mkgrp           h5repack       ph5diff
</pre>

== NETCDF ==

Las librerías netCDF tienen 2 interfaces, una para c y otra para Fortran. Otra vez realizamos la instalación desde el directorio <code>$INSWORKDIR</code>.

=== netcdf-c ===
Se descarga directamente de la ultima versión del repositorio (Nov 22)

<pre style="shell">
$ cd $INSWORKDIR
$ mkdir -p netcdf/intel/parallel
$ cd netcdf/intel/parallel
$ git clone https://github.com/Unidata/netcdf-c.git
$ cd netcdf-c
</pre>

Se instalarán las librerías en <code>NETCDF=$INSWORKDIR/netcdf/intel/parallel/ins</code>
<pre style="shell">
$ mkdir $INSWORKDIR/netcdf/intel/parallel/ins
export NETCDF=$INSWORKDIR/netcdf/intel/parallel/ins
CC=mpicc LDFLAGS=-L$HDF5/lib LIBS=-lhdf5 CPPFLAGS=-I$HDF5/include
./configure --prefix=$NETCDF >& run_configure.log
</pre>




=== netcdf-Fortran ===

<pre style="shell">
$ wget https://github.com/Unidata/netcdf-fortran/archive/refs/tags/v4.6.1.tar.gz
</pre>