Guía de usuario del SCAD del CIMA
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Por defecto no se cargan variables de entorno para los compiladores. |
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− | * Si desea utilizar compiladores '''GNU''' es necesario ejecutar el siguiente comando: |
+ | * Puedes listar las librerías disponibles y seleccionar la deseada ejecutando: |
− | source /opt/load-libs gnu |
+ | load-libs |
− | * Si desea utilizar compiladores '''Intel''' es necesario ejecutar el siguiente comando: |
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− | source /opt/load-libs intel |
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* Las librerías y modelos se encuentran instalados en: |
* Las librerías y modelos se encuentran instalados en: |
Revisión de 09:44 25 abr 2022
Elegir librerías a utilizar (Intel o GNU)
Por defecto no se cargan variables de entorno para los compiladores.
- Puedes listar las librerías disponibles y seleccionar la deseada ejecutando:
load-libs
- Las librerías y modelos se encuentran instalados en:
/opt
- Dentro de cada directorio se encuentra la versión de la librería o modelo según el compilador utilizado. Por ejemplo:
/opt/wrf/WRF-4.3.2/intel
o
/opt/wrf/WRF-4.3.2/gnu
Para ejecutar un trabajo:
- En el archivo pbs elijo la cantidad de nodos y procesadores que quiero utilizar. Ejemplo para 8 nodos de 1 procesador cada uno:
#PBS -l nodes=8:ppn=1 PROC_NO=8
- Otro ejemplo es elegir 3 nodos de dos procesadores cada uno:
#PBS -l nodes=3:ppn=2 PROC_NO=6
- Por último, debemos indicar que cola se usará. Actualmente hay sólo una cola (larga)
#PBS -q larga
- Una vez que esta todo modificado ejecutamos:
qsub corrida.pbs
- Para visualizar lo que ejecutamos y el estado:
qstat –n
- Para matar el trabajo que enviamos:
qdel <número de trabajo> (número de trabajo lo sabemos haciendo qstat –n)
- Config de un archivo PBS típico
## Job Name #PBS -N nombreJob ## Novedades por mail #PBS -m abe #PBS -M <my.user>@cima.fcen.uba.ar ## Joins standard and Error outputs in a single file #PBS -j oe ## Queue #PBS -q larga ## resources #PBS -l nodes=3:ppn=1