RegIPSL/CompHDF NC
De Wikicima
(Diferencias entre revisiones)
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export HDF5=$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/ins |
export HDF5=$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/ins |
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| − | CC=mpicc FC=mpif90 CFLAGS=-fPIC ./configure --enable-shared --enable-parallel --enable-fortran --enable-fortran2003 --prefix=$HDF5 >& ./run_configure.log |
+ | CC=mpicc FC=mpif90 CFLAGS=-fPIC |
| + | ./configure --enable-shared --enable-parallel --enable-fortran --enable-fortran2003 --prefix=$HDF5 >& ./run_configure.log |
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make && make install >& run_make.log |
make && make install >& run_make.log |
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Revisión de 11:41 22 nov 2023
Compilación en paralelo de HDF5 y netCDF en hydra
Se siguen estas instrucciones de acá
Descargamos los códigos en el $INSWORKDIR (en este caso INSWORKDIR=/home/lluis.fita/installs/<code>):
Compilaremos con intel, así que cargamos el entorno correspondiente:
$ source /opt/load-libs.sh 1
HDF5
HDF5 de la página HDF5source (archivo $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/hdf5-1.14.3.tar.gz)
$ cd $INSWORKDIR $ mkdir hdf5 $ mkdir -p 1.14.3/intel/parallel $ cd 1.14.3/intel/parallel $ mkdir ins $ cd hdf5-1.14.3 $ tar xvfz ../../hdf5-1.14.3.tar.gz
Compilamos el codigo en el directorio <code>$HDF5 (estando en $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/hdf5-1.14.3</pre>)
export HDF5=$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/ins CC=mpicc FC=mpif90 CFLAGS=-fPIC ./configure --enable-shared --enable-parallel --enable-fortran --enable-fortran2003 --prefix=$HDF5 >& ./run_configure.log make && make install >& run_make.log
NETCDF
$ git clone https://github.com/Unidata/netcdf-c.git
