RegIPSL/CompHDF NC
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(Diferencias entre revisiones)
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== HDF5 == |
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| − | HDF5 de la página [https://www.hdfgroup.org/downloads/hdf5/source-code/ HDF5source] (archivo $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/hdf5-1.14.3.tar.gz) |
+ | HDF5 de la página [https://www.hdfgroup.org/downloads/hdf5/source-code/ HDF5source] (archivo <code>$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/hdf5-1.14.3.tar.gz</code>) |
<pre stye="shell"> |
<pre stye="shell"> |
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| − | Compilamos el código en el directorio <code>$HDF5</code> (estando en $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/hdf5-1.14.3</pre>) |
+ | Compilamos el código en el directorio <code>$HDF5</code> (estando en <code>$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/hdf5-1.14.3</code>) |
<pre style="shell"> |
<pre style="shell"> |
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export HDF5=$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/ins |
export HDF5=$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/ins |
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Revisión de 11:43 22 nov 2023
Compilación en paralelo de HDF5 y netCDF en hydra
Se siguen estas instrucciones de acá
Descargamos los códigos en el $INSWORKDIR (en este caso INSWORKDIR=/home/lluis.fita/installs/<code>):
Compilaremos con intel, así que cargamos el entorno correspondiente:
$ source /opt/load-libs.sh 1
HDF5
HDF5 de la página HDF5source (archivo <code>$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/hdf5-1.14.3.tar.gz)
$ cd $INSWORKDIR $ mkdir hdf5 $ mkdir -p 1.14.3/intel/parallel $ cd 1.14.3/intel/parallel $ mkdir ins $ cd hdf5-1.14.3 $ tar xvfz ../../hdf5-1.14.3.tar.gz
Compilamos el código en el directorio $HDF5 (estando en $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/hdf5-1.14.3)
export HDF5=$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/ins CC=mpicc FC=mpif90 CFLAGS=-fPIC ./configure --enable-shared --enable-parallel --enable-fortran --enable-fortran2003 --prefix=$HDF5 >& ./run_configure.log make && make install >& run_make.log
NETCDF
$ git clone https://github.com/Unidata/netcdf-c.git
