papa-deimos/uso

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Toda persona del CIMA/DCAO tiene acceso al equipamiento.
  
Toda persona del CIMA/DCAO tiene acceso al equipamiento.
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[http://deimos.cima.fcen.uba.ar/ http://deimos.cima.fcen.uba.ar/]
  
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Por el momento, sólo está activado los notebooks de 'python'. Se espera poder activar los de 'R' pronto.
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Por el momento, están activados los notebooks de 'python', 'R' y 'shell'. Cada tipo de '' `notebook' '' se selecciona en el menú desplegable llamado ''`new''' (arriba a la derecha, ver imagen).
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'''NOTA:''' No se permite la creación de entornos python. Si se necesitan paquetes específicos, pídanlos a Lluís Fita
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== Usuaries ==
  
== Usuaries ==
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Les usuaries se conectan y se abren una sesión activa en un ''`note book''' y se empieza a trabajar con los datos
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Les usuaries se conectan y se abren una sesión activa en un '' `notebook' '' y se empieza a trabajar con los datos
   
 
* CIMA: Usuaries CIMA con la cuenta creada, usan el mismo nombre del correo (sin <code>@cima.fcen.uba.ar</code>) y con la misma contraseña que la del correo
  
* CIMA: Usuaries CIMA con la cuenta creada, usan el mismo nombre del correo (sin <code>@cima.fcen.uba.ar</code>) y con la misma contraseña que la del correo
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== Datos ==
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== Sesión activa sin conexión ==
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Existe una manera de dejar corriendo un kernel de python y cerrar la sesión en Papa-Deimos. Para eso se utiliza el ''decorator'' <code>%%capture</code>
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A continuación se describe un ejemplo muy sencillo.
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Este sería el código en una celda:
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<pre style="python">
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%%capture mi_salida
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import time
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Ntimes = 10
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Nseconds = 10
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for it in range(Ntimes):
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print (it)
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time.sleep(Nseconds)
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</pre>
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Se ejecuta la celda y se sale de la sesión de Papa-Deimos.
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Cuando volvemos a conectarnos, sólo hace falta ir al kernel y en la celda posterior escribir:
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mi_salida.show()
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y al ejecutar la celda del kernel:
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== kernels/entornos ==
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No se autoriza la creación de entornos por usuario. Si existiera algún problema, se ruega pedir auyda a Lluís Fita.
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A continuación se describen los paquetes adicionales que contienen los kernels activos
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* Bash: entorno estándard de shell
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* Python3 (D. E. Hachkathon): xarray, dask, [https://intake.readthedocs.io/en/latest/index.html intake], [https://healpix.sourceforge.io/ HEALpix], [https://easy.gems.dkrz.de/Processing/healpix/index.html easy.gems HEALPix], healpy, [https://zarr.dev/ py-zarr], [https://tobac.readthedocs.io/en/latest/ Tobac], [https://github.com/FlexTRKR/PyFLEXTRKR PyFLEXTRKR]
  +
* Python3 (atrackcs): [https://github.com/ATRACKCS/ATRACKCS ATRACKCS]
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* Python3 (ipykernel): estándard python3
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* R: básico R

Última revisión de 16:13 21 mayo 2025

[editar] Uso de papa-deimos

Contenido


Toda persona del CIMA/DCAO tiene acceso al equipamiento.

Se tiene que mandar un correo a Lluís para que active la cuenta.

Una vez la cuenta activada, el acceso se hace por registro de usuarie desde

http://deimos.cima.fcen.uba.ar/

Por el momento, están activados los notebooks de 'python', 'R' y 'shell'. Cada tipo de `notebook' se selecciona en el menú desplegable llamado `new' (arriba a la derecha, ver imagen).

NOTA: No se permite la creación de entornos python. Si se necesitan paquetes específicos, pídanlos a Lluís Fita

jupyterHUB home small.png

Todos los archivos que se creen aparecen en la ventana inicial para poderse descargar

[editar] Usuaries

Les usuaries se conectan y se abren una sesión activa en un `notebook' y se empieza a trabajar con los datos

  • CIMA: Usuaries CIMA con la cuenta creada, usan el mismo nombre del correo (sin @cima.fcen.uba.ar) y con la misma contraseña que la del correo

Cada [usarie] tendrá un home del gitHUB ubicado en 

/home/jupyter-[usuarie]

[editar] Sesión activa sin conexión

Existe una manera de dejar corriendo un kernel de python y cerrar la sesión en Papa-Deimos. Para eso se utiliza el decorator %%capture

A continuación se describe un ejemplo muy sencillo.

Este sería el código en una celda: 

%%capture mi_salida

import time

Ntimes = 10
Nseconds = 10

for it in range(Ntimes):
    print (it)
    time.sleep(Nseconds)

Se ejecuta la celda y se sale de la sesión de Papa-Deimos.

Cuando volvemos a conectarnos, sólo hace falta ir al kernel y en la celda posterior escribir: 

mi_salida.show()

y al ejecutar la celda del kernel: 

0
1
2
3
4
5
6
7
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9

[editar] kernels/entornos

No se autoriza la creación de entornos por usuario. Si existiera algún problema, se ruega pedir auyda a Lluís Fita.

A continuación se describen los paquetes adicionales que contienen los kernels activos

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