RegIPSL/CompHDF NC
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(Diferencias entre revisiones)
(→Compilación en paralelo de HDF5 y netCDF en hydra) |
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Descargamos los códigos en el <code>$INSWORKDIR</code> (en este caso <code>INSWORKDIR=/home/lluis.fita/installs/<code>): |
Descargamos los códigos en el <code>$INSWORKDIR</code> (en este caso <code>INSWORKDIR=/home/lluis.fita/installs/<code>): |
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+ | Compilaremos con intel, así que cargamos el entorno correspondiente: |
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+ | <pre style="shell"> |
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+ | $ source /opt/load-libs.sh 1 |
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+ | </pre> |
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+ | == HDF5 == |
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HDF5 de la página [https://www.hdfgroup.org/downloads/hdf5/source-code/ HDF5source] (archivo $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/hdf5-1.14.3.tar.gz) |
HDF5 de la página [https://www.hdfgroup.org/downloads/hdf5/source-code/ HDF5source] (archivo $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/hdf5-1.14.3.tar.gz) |
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+ | == NETCDF == |
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Revisión de 11:39 22 nov 2023
Compilación en paralelo de HDF5 y netCDF en hydra
Se siguen estas instrucciones de acá
Descargamos los códigos en el $INSWORKDIR
(en este caso INSWORKDIR=/home/lluis.fita/installs/<code>):
Compilaremos con intel, así que cargamos el entorno correspondiente:
$ source /opt/load-libs.sh 1
HDF5
HDF5 de la página HDF5source (archivo $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/hdf5-1.14.3.tar.gz)
$ cd $INSWORKDIR $ mkdir hdf5 $ mkdir -p 1.14.3/intel/parallel $ cd 1.14.3/intel/parallel $ mkdir ins $ cd hdf5-1.14.3 $ tar xvfz ../../hdf5-1.14.3.tar.gz
Compilamos el codigo en el directorio <code>$HDF5 (estando en $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/hdf5-1.14.3</pre>)
export HDF5=$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/ins CC=mpicc FC=mpif90 CFLAGS=-fPIC ./configure --enable-shared --enable-parallel --enable-fortran --enable-fortran2003 --prefix=$HDF5 make && make install
NETCDF
$ git clone https://github.com/Unidata/netcdf-c.git