RegIPSL/CompHDF NC
De Wikicima
(Diferencias entre revisiones)
(→HDF5) |
(→HDF5) |
||
| Línea 23: | Línea 23: | ||
</pre> |
</pre> |
||
| − | Compilamos el codigo en el directorio <code>$HDF5</code> (estando en $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/hdf5-1.14.3</pre>) |
+ | Compilamos el código en el directorio <code>$HDF5</code> (estando en $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/hdf5-1.14.3</pre>) |
<pre style="shell"> |
<pre style="shell"> |
||
export HDF5=$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/ins |
export HDF5=$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/ins |
||
Revisión de 11:42 22 nov 2023
Compilación en paralelo de HDF5 y netCDF en hydra
Se siguen estas instrucciones de acá
Descargamos los códigos en el $INSWORKDIR (en este caso INSWORKDIR=/home/lluis.fita/installs/<code>):
Compilaremos con intel, así que cargamos el entorno correspondiente:
$ source /opt/load-libs.sh 1
HDF5
HDF5 de la página HDF5source (archivo $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/hdf5-1.14.3.tar.gz)
$ cd $INSWORKDIR $ mkdir hdf5 $ mkdir -p 1.14.3/intel/parallel $ cd 1.14.3/intel/parallel $ mkdir ins $ cd hdf5-1.14.3 $ tar xvfz ../../hdf5-1.14.3.tar.gz
Compilamos el código en el directorio <code>$HDF5 (estando en $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/hdf5-1.14.3</pre>)
export HDF5=$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/ins CC=mpicc FC=mpif90 CFLAGS=-fPIC ./configure --enable-shared --enable-parallel --enable-fortran --enable-fortran2003 --prefix=$HDF5 >& ./run_configure.log make && make install >& run_make.log
NETCDF
$ git clone https://github.com/Unidata/netcdf-c.git
