papa-deimos/instalacion

En papa

$ mkdir -p ~/sandbox/copy/
$ mkdir -p ~/sandbox/get/
$ sudo mkdir -p /datos/MOD/re-analysis/ECMWF/ERA5/monmean
$ sudo mv ~/sandbox/copy/ERA5_monmean_* /datos/MOD/re-analysis/ECMWF/ERA5/monmean/

Instalación para descargar datos del ECMWF via la API

$ sudo apt-get install python3-pip
$ sudo pip3 install ecmwf-api-client

Instalación para descagar datos de Copernicus via la cdstoolbox

$ sudo pip3 install cdstoolbox-remote

En deimos

JupyterHub, tiene su propia instalación de python y por lo tanto de sus paquetes. Ver expliacición acá

$ sudo su
# apt-get install git subversion
# apt-get install python3 python3-scipy python3-numpy cython3 cython3-dbg 
# apt-get install netcdf-bin libnetcdf-dev netcdf-doc libnetcdff-dev libnetcdff-doc libhdf5-dev libhdf5-dev ncview cdo nco
# apt-get install dvipng python3-netcdf4
# apt-get install python3-matplotlib python3-matplotlib-dbg
# apt-get install python3-cartopy python-cartopy-data python3-mpltoolkits.basemap
# apt-get install firefox-esr firefox-esr-l10n-all
# apt-get install gfortran
# apt-get install imagemagick

El python the jupyterHub del usuario (?) es este /opt/tljh/user/bin/python3, por lo tanto, se tiene que instalar usando el pip de ese directorio

# /opt/tljh/user/bin/pip3 install numpy
# /opt/tljh/user/bin/pip3 install netcdf4
# /opt/tljh/user/bin/pip3 install matplotlib
# /opt/tljh/user/bin/conda install gcc
# apt-get install libgeos-dev
# /opt/tljh/user/bin/pip3 install cartopy

Está por ver, si les otres usuaries verán los paquetes. O cómo hacerlo desde un entorno?

Instalando un kernel de R

Instalando R en deimos

sudo apt-get install r-base r-base-core r-base-core-dbg r-base-dev

Creando el irkernel en JupyerHub siguiendo estas instrucciones

Añadir usuaries

En deimos

# adduser -m [NombreUsuario]
# sudo passwd [NombreUsuario]

El sistema papa-deimos, se pudo constituir en parte, gracias a fondos del INSU - LEFE