RegIPSL/CompHDF NC
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(Diferencias entre revisiones)
(→Compilación en paralelo de HDF5 y netCDF en hydra) |
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| Línea 11: | Línea 11: | ||
$ mkdir -p 1.14.3/intel/parallel |
$ mkdir -p 1.14.3/intel/parallel |
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$ cd 1.14.3/intel/parallel |
$ cd 1.14.3/intel/parallel |
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| − | $ tar xvfz ../../hdf5-1.14.3.tar.gz |
+ | $ mkdir ins |
$ cd hdf5-1.14.3 |
$ cd hdf5-1.14.3 |
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| + | $ tar xvfz ../../hdf5-1.14.3.tar.gz |
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| + | </pre> |
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| + | |||
| + | Compilamos el codigo en el directorio <code>$HDF5</code> (estando en $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/hdf5-1.14.3</pre>) |
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| + | <pre style="shell"> |
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| + | export HDF5=$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/ins |
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| + | CC=mpicc FC=mpif90 CFLAGS=-fPIC ./configure --enable-shared --enable-parallel --enable-fortran --enable-fortran2003 --prefix=$HDF5 |
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| + | make && make install |
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</pre> |
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<pre style="shell"> |
<pre style="shell"> |
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Revisión de 11:38 22 nov 2023
Compilación en paralelo de HDF5 y netCDF en hydra
Se siguen estas instrucciones de acá
Descargamos los códigos en el $INSWORKDIR (en este caso INSWORKDIR=/home/lluis.fita/installs/<code>):
HDF5 de la página HDF5source (archivo $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/hdf5-1.14.3.tar.gz)
$ cd $INSWORKDIR $ mkdir hdf5 $ mkdir -p 1.14.3/intel/parallel $ cd 1.14.3/intel/parallel $ mkdir ins $ cd hdf5-1.14.3 $ tar xvfz ../../hdf5-1.14.3.tar.gz
Compilamos el codigo en el directorio <code>$HDF5 (estando en $INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/hdf5-1.14.3</pre>)
export HDF5=$INSWORKDIR/hdf5/1.14.3/intel/parallel/ins CC=mpicc FC=mpif90 CFLAGS=-fPIC ./configure --enable-shared --enable-parallel --enable-fortran --enable-fortran2003 --prefix=$HDF5 make && make install
$ git clone https://github.com/Unidata/netcdf-c.git
